20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1060 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  225  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  42.61 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  45.61 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  41.82 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  42.72 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  41.75 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  41.75 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  41.82 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  41.74 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  42.06 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  42 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  34.82 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  36.13 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  38.68 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  44.74 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  42.68 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  35.45 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  35.48 
 
 
144 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>