27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0193 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  100 
 
 
148 aa  285  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  72.18 
 
 
129 aa  186  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  65.89 
 
 
127 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  65.89 
 
 
127 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  65.89 
 
 
127 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  64.71 
 
 
123 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  53.21 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  52.68 
 
 
118 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  42.48 
 
 
138 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  50.48 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  41.28 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  46.53 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  44.93 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  38.21 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  47.71 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  39.02 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  42.5 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  41.41 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  53.61 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  43.36 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  41.9 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  47.44 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  34.01 
 
 
141 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2784  hypothetical protein  37.1 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  39.78 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  32.23 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3780  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00228572  normal  0.0675277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>