12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0246 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0246  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  268  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  78.57 
 
 		 141 aa  213  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3780  hypothetical protein  42.74 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00228572  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0051  hypothetical protein  35.11 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45766  predicted protein  40.5 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15399  predicted protein  40.83 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581313  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0404  hypothetical protein  35.48 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2033  hypothetical protein  29.17 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.127382  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  30.6 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0600  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2057  hypothetical protein  32.82 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  29.46 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>