38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0338 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  527  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  50.83 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  45.56 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  46.33 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  33.76 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  29.78 
 
 		 420 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  38.17 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  27.56 
 
 		 452 aa  95.5  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  37.12 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  41.54 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  28.31 
 
 		 416 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  28.28 
 
 		 413 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  27.5 
 
 		 387 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  27.5 
 
 		 387 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  30 
 
 		 731 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  25.66 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  33.58 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  34.13 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  34.38 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  32.18 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  23.08 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  22.83 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0098  hypothetical protein  30.58 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.888213  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  24.51 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  23.91 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  24.19 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  21.99 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  26.53 
 
 		 1035 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  23.04 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  27.59 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  23.47 
 
 		 361 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 450 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1114  hypothetical protein  24.71 
 
 		 413 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0990251  normal  0.0233772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  25.93 
 
 		 903 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  26.21 
 
 		 163 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1373  hypothetical protein  25.4 
 
 		 320 aa  45.4  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  29.81 
 
 		 862 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>