40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0496 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  100 
 
 
387 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  100 
 
 
387 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  66.75 
 
 
420 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  65.94 
 
 
416 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  63.02 
 
 
413 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  62.32 
 
 
416 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  60.49 
 
 
452 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  48.09 
 
 
731 aa  322  5e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  36.25 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  36.91 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  36.83 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  35.46 
 
 
365 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  34.77 
 
 
360 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  33.59 
 
 
366 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  34.77 
 
 
360 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  33.76 
 
 
361 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  32.23 
 
 
368 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  46.36 
 
 
1035 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  50.49 
 
 
903 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  40.74 
 
 
862 aa  92.8  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  27 
 
 
261 aa  86.3  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  26.15 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  31.39 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  30.13 
 
 
244 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  25.13 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  28.12 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  33.58 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  32.43 
 
 
163 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  30.37 
 
 
248 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  25.78 
 
 
273 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1114  hypothetical protein  30.26 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0990251  normal  0.0233772 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  30.08 
 
 
221 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1134  hypothetical protein  32.4 
 
 
466 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00871122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1075  hypothetical protein  32.96 
 
 
447 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1203  hypothetical protein  31.84 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502395  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  37.5 
 
 
497 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0098  hypothetical protein  26.67 
 
 
236 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.888213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  17.8 
 
 
256 aa  43.1  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>