35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00861 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  90.56 
 
 
366 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  94.46 
 
 
366 aa  699    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  77.07 
 
 
368 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  56.04 
 
 
365 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  58.5 
 
 
357 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  56.68 
 
 
360 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  56.52 
 
 
360 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  56.71 
 
 
363 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  51.63 
 
 
365 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  35.05 
 
 
452 aa  229  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  35.28 
 
 
416 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  35.57 
 
 
413 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  33.49 
 
 
420 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  34.06 
 
 
416 aa  223  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  33.76 
 
 
387 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  33.76 
 
 
387 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  32.71 
 
 
1035 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  48.09 
 
 
731 aa  116  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  34.25 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  23.97 
 
 
497 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  38.04 
 
 
903 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1503  hypothetical protein  79.07 
 
 
132 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.455451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  27.59 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  25.21 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  24.63 
 
 
261 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  29.21 
 
 
244 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  27.03 
 
 
251 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  25.31 
 
 
221 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  30.19 
 
 
273 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  22.1 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  28.09 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1407  hypothetical protein  24.82 
 
 
179 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  25.16 
 
 
244 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01061  hypothetical protein  25.55 
 
 
179 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  0.482595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>