36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0398 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  741    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  86.78 
 
 		 357 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  70.57 
 
 		 365 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  61.83 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  64.82 
 
 		 360 aa  454  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  65.1 
 
 		 360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  57.26 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  56.13 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  55.34 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  56.71 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  38.77 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  39.67 
 
 		 452 aa  253  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  35.94 
 
 		 416 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  36.25 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  35.7 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  36.25 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  34.14 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  29.97 
 
 		 1035 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  30.17 
 
 		 731 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  44.21 
 
 		 163 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  31.73 
 
 		 903 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  29.84 
 
 		 248 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  24.19 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  27.87 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  22.83 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  23.62 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  31.5 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  32.63 
 
 		 244 aa  53.1  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  29.92 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  24.76 
 
 		 862 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  23.7 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  25.41 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1407  hypothetical protein  27.06 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01061  hypothetical protein  25.88 
 
 		 179 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  0.482595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  25.83 
 
 		 221 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>