41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4273 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  100 
 
 		 416 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  86.78 
 
 		 416 aa  758    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  75.71 
 
 		 420 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  73.57 
 
 		 413 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  66.43 
 
 		 452 aa  564  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  65.94 
 
 		 387 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  65.94 
 
 		 387 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  56.64 
 
 		 731 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  39.48 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  35.1 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  35.45 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  35.28 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  35.02 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  34.62 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  34.93 
 
 		 365 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  33.17 
 
 		 368 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  31.9 
 
 		 360 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  31.9 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  48.6 
 
 		 903 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  46.36 
 
 		 1035 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  27.78 
 
 		 261 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  36.7 
 
 		 862 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  33.58 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  34.07 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  25.89 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  34.75 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  32 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  34.04 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  36.15 
 
 		 221 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  24.12 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  30.88 
 
 		 248 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  25.66 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  26.44 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1114  hypothetical protein  31.37 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0990251  normal  0.0233772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  32.91 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1134  hypothetical protein  64.52 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00871122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  20.83 
 
 		 256 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1075  hypothetical protein  61.29 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1203  hypothetical protein  61.29 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502395  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06651  hypothetical protein  28 
 
 		 183 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0098  hypothetical protein  28.95 
 
 		 236 aa  43.5  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.888213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>