27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0589 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 
256 aa  504  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  32.92 
 
 
261 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  27.85 
 
 
251 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  28.86 
 
 
251 aa  99  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  28.1 
 
 
263 aa  89  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  26.67 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  30.63 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  22.51 
 
 
452 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  23.53 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  25.66 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  21.66 
 
 
731 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  25.93 
 
 
365 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  21.88 
 
 
413 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  27.61 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  20.83 
 
 
416 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  17.8 
 
 
387 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3087  hypothetical protein  28.57 
 
 
450 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  17.8 
 
 
387 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  19.47 
 
 
420 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1385  hypothetical protein  28.46 
 
 
185 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000684227  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  27.88 
 
 
368 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  19.79 
 
 
416 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0098  hypothetical protein  28.68 
 
 
236 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.888213  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  23.6 
 
 
366 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  23.93 
 
 
357 aa  42  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>