33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02991 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  69.59 
 
 
357 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  68.94 
 
 
363 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  61.23 
 
 
365 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  58.49 
 
 
360 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  58.22 
 
 
360 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  53.13 
 
 
366 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  51.9 
 
 
368 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  52.86 
 
 
366 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  51.63 
 
 
361 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  40.2 
 
 
413 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  39.48 
 
 
416 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  38.21 
 
 
420 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  38.66 
 
 
452 aa  248  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  37.95 
 
 
416 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  36.91 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  36.91 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  31.56 
 
 
731 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  30.45 
 
 
1035 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  42.42 
 
 
163 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  31.21 
 
 
903 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  23.91 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  26.32 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  26.23 
 
 
235 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  33.68 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  24.32 
 
 
261 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  25.44 
 
 
244 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  28.17 
 
 
862 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  28.1 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  23.76 
 
 
251 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  22.1 
 
 
251 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  21.74 
 
 
256 aa  46.2  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  29.07 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>