28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20131 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  336  9e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  44.68 
 
 		 363 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  42.42 
 
 		 365 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  41.67 
 
 		 360 aa  87.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  41.49 
 
 		 360 aa  87.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  42.55 
 
 		 357 aa  87  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  38.14 
 
 		 366 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  39.36 
 
 		 365 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  34.25 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  38.95 
 
 		 366 aa  81.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  38.3 
 
 		 368 aa  80.5  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  35.11 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  34.04 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  32.43 
 
 		 387 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  32.43 
 
 		 387 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  36.17 
 
 		 452 aa  72  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  34.04 
 
 		 413 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  29.29 
 
 		 731 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  29.79 
 
 		 420 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  28.81 
 
 		 1035 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  27.62 
 
 		 903 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  29.89 
 
 		 497 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  25.71 
 
 		 261 aa  47.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1407  hypothetical protein  26.04 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01061  hypothetical protein  26.04 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  0.482595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  31.58 
 
 		 862 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06651  hypothetical protein  26.58 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  27.55 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>