33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0077 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  90.56 
 
 		 361 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  90.98 
 
 		 366 aa  682    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  75.41 
 
 		 368 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  58.5 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  55.98 
 
 		 365 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  57.49 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  56.95 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  56.71 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  53.13 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  34.8 
 
 		 452 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  34.62 
 
 		 416 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  35.56 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  32.94 
 
 		 420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  33.65 
 
 		 416 aa  223  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  33.59 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  33.59 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  32.26 
 
 		 1035 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  31.8 
 
 		 731 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  38.95 
 
 		 163 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  24.63 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  33.64 
 
 		 903 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1503  hypothetical protein  58.46 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.455451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  26.23 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  27.27 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  24.58 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  31.13 
 
 		 273 aa  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  21.68 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  30.77 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  29.21 
 
 		 248 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  29.21 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  25.31 
 
 		 221 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>