50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2252 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2252  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  697    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1185  hypothetical protein  34.65 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0709  hypothetical protein  33.11 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1927  hypothetical protein  27.65 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0266  hypothetical protein  27.65 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1837  hypothetical protein  27.94 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421612  normal  0.203773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1650  hypothetical protein  26.78 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00643743  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1666  hypothetical protein  30.79 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4052  hypothetical protein  31.29 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1822  hypothetical protein  26.61 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000314938  normal  0.174335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1966  hypothetical protein  28.79 
 
 		 370 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000283183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1778  hypothetical protein  26.33 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000002473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2500  hypothetical protein  26.33 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000222884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1785  hypothetical protein  26.33 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000593436  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2878  hypothetical protein  26.21 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1224  hypothetical protein  30.99 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.01444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1575  hypothetical protein  26.57 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156633  normal  0.143123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1642  hypothetical protein  26.57 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.03169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1264  hypothetical protein  30.32 
 
 		 355 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3688  hypothetical protein  32.17 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000276179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2442  hypothetical protein  27.45 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.500512  normal  0.0434614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0947  hypothetical protein  27.97 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2163  hypothetical protein  26.95 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1701  hypothetical protein  32.24 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2488  hypothetical protein  27.12 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1690  hypothetical protein  25.61 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.165734  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4563  hypothetical protein  33.05 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1634  hypothetical protein  31.3 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.395754  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2387  hypothetical protein  24.56 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2807  hypothetical protein  22.75 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.157687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1750  hypothetical protein  24 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0668546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36880  hypothetical protein  33.19 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3195  hypothetical protein  23.53 
 
 		 477 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1070  hypothetical protein  23.57 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02147  hypothetical protein  32.34 
 
 		 465 aa  92.8  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52020  hypothetical protein  30.86 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1917  hypothetical protein  27.35 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002784  hypothetical protein  25.99 
 
 		 402 aa  89.4  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0895  translation elongation factor G  26.64 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000943112 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03197  hypothetical protein  26.8 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1642  hypothetical protein  27.38 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00221365  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2995  hypothetical protein  31.44 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.604355  hitchhiker  0.00130055 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0517  hypothetical protein  28.28 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700394 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1649  hypothetical protein  27.65 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368995  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1748  hypothetical protein  24.7 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.592425  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1719  hypothetical protein  27.65 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.604615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0554  Protein of unknown function DUF2066  28.57 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0970  hypothetical protein  26.89 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4255  hypothetical protein  26.88 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313967  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02242  hypothetical protein  25.33 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>