38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02242 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02242  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  694    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0970  hypothetical protein  65.93 
 
 		 375 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1719  hypothetical protein  62.99 
 
 		 387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.604615  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1649  hypothetical protein  62.71 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1927  hypothetical protein  25.08 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1185  hypothetical protein  27.81 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0266  hypothetical protein  24.76 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2488  hypothetical protein  27.41 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0895  translation elongation factor G  26.85 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000943112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3195  hypothetical protein  22.05 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1750  hypothetical protein  25.16 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0668546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1966  hypothetical protein  23.87 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000283183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0947  hypothetical protein  23.64 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2252  hypothetical protein  25.57 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1837  hypothetical protein  24.19 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421612  normal  0.203773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0709  hypothetical protein  25.5 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1070  hypothetical protein  21.74 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002784  hypothetical protein  21.1 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02147  hypothetical protein  26.03 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1917  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2387  hypothetical protein  23.15 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1642  hypothetical protein  22.4 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00221365  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1748  hypothetical protein  21.07 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.592425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2995  hypothetical protein  25.51 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.604355  hitchhiker  0.00130055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2163  hypothetical protein  20.81 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4563  hypothetical protein  24.91 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2442  hypothetical protein  21.02 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.500512  normal  0.0434614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36880  hypothetical protein  24.12 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52020  hypothetical protein  23.9 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3688  hypothetical protein  23.21 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000276179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2807  hypothetical protein  23.15 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.157687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1634  hypothetical protein  25.21 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.395754  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1701  hypothetical protein  23.63 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1778  hypothetical protein  22.29 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000002473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1822  hypothetical protein  22.29 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000314938  normal  0.174335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1785  hypothetical protein  25.69 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000593436  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2500  hypothetical protein  25.69 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000222884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1264  hypothetical protein  26.53 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>