38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1719 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1719  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  776    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.604615  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1649  hypothetical protein  98.37 
 
 		 368 aa  723    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02242  hypothetical protein  62.99 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0970  hypothetical protein  59.46 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1185  hypothetical protein  30.26 
 
 		 351 aa  96.3  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2252  hypothetical protein  27.65 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3195  hypothetical protein  30.73 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0895  translation elongation factor G  25.32 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000943112 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1927  hypothetical protein  22.98 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0266  hypothetical protein  22.67 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0947  hypothetical protein  24.86 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0709  hypothetical protein  24.33 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2488  hypothetical protein  24.29 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52020  hypothetical protein  28.7 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36880  hypothetical protein  27.31 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1966  hypothetical protein  23.81 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000283183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1750  hypothetical protein  21.61 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0668546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2995  hypothetical protein  28.99 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.604355  hitchhiker  0.00130055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4563  hypothetical protein  27.71 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002784  hypothetical protein  22.78 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1070  hypothetical protein  22.29 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1264  hypothetical protein  28.02 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1917  hypothetical protein  23.71 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1634  hypothetical protein  25.76 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.395754  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1748  hypothetical protein  21.93 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.592425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2807  hypothetical protein  23.99 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.157687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1224  hypothetical protein  26.26 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.01444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4052  hypothetical protein  26.29 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1666  hypothetical protein  26.29 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3688  hypothetical protein  24.68 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000276179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4255  hypothetical protein  29.19 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313967  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02147  hypothetical protein  22.66 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1785  hypothetical protein  27.21 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000593436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1642  hypothetical protein  21.38 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00221365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2500  hypothetical protein  27.21 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000222884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1822  hypothetical protein  27.21 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000314938  normal  0.174335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1778  hypothetical protein  27.21 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000002473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1837  hypothetical protein  22.15 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421612  normal  0.203773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>