49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1837 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1837  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  763    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421612  normal  0.203773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2163  hypothetical protein  48.28 
 
 		 369 aa  362  9e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2442  hypothetical protein  47.46 
 
 		 369 aa  348  6e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.500512  normal  0.0434614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1966  hypothetical protein  44.92 
 
 		 370 aa  322  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000283183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1642  hypothetical protein  46.65 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.03169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2500  hypothetical protein  44.34 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000222884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1785  hypothetical protein  44.34 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000593436  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2878  hypothetical protein  45.12 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1822  hypothetical protein  44.34 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000314938  normal  0.174335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1778  hypothetical protein  44.34 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000002473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1575  hypothetical protein  46.04 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156633  normal  0.143123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1690  hypothetical protein  44.95 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.165734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1650  hypothetical protein  46.34 
 
 		 359 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00643743  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1750  hypothetical protein  41.16 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0668546  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1642  hypothetical protein  40.37 
 
 		 392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00221365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1917  hypothetical protein  38.36 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100608  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3195  hypothetical protein  27.06 
 
 		 477 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2488  hypothetical protein  30.31 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2807  hypothetical protein  26.87 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.157687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002784  hypothetical protein  26.75 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1070  hypothetical protein  28.43 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03197  hypothetical protein  27.35 
 
 		 437 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02147  hypothetical protein  34.94 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1748  hypothetical protein  29.17 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.592425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2252  hypothetical protein  27.94 
 
 		 358 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1185  hypothetical protein  25.48 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1927  hypothetical protein  24.76 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0266  hypothetical protein  24.76 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0895  translation elongation factor G  26.28 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000943112 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0947  hypothetical protein  24.47 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4052  hypothetical protein  25.99 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1666  hypothetical protein  25.99 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1264  hypothetical protein  25.66 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640884 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0709  hypothetical protein  22.81 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1224  hypothetical protein  26.6 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.01444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1634  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.395754  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36880  hypothetical protein  30.68 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2387  hypothetical protein  23 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4563  hypothetical protein  26.91 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1701  hypothetical protein  26.07 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3688  hypothetical protein  26.69 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000276179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52020  hypothetical protein  27.87 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2995  hypothetical protein  27.13 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.604355  hitchhiker  0.00130055 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0554  Protein of unknown function DUF2066  26.47 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02242  hypothetical protein  23.2 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0970  hypothetical protein  28.37 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0517  hypothetical protein  22.65 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1719  hypothetical protein  22.15 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.604615  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1649  hypothetical protein  22.15 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>