36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0957 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0957  zinc finger CDGSH-type domain protein  100 
 
 		 81 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.23 
 
 		 502 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3910  zinc finger CDGSH-type domain protein  67.53 
 
 		 82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  57.33 
 
 		 518 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.49 
 
 		 516 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.69 
 
 		 516 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.97 
 
 		 516 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.13 
 
 		 514 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3396  Zinc finger, CDGSH-type  58.44 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.41 
 
 		 510 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1679  zinc finger CDGSH-type domain protein  54.55 
 
 		 79 aa  100  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  52.56 
 
 		 515 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1719  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  59.72 
 
 		 79 aa  94.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.703607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2171  hypothetical protein  58.11 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00528546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0430  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  50.65 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0862  hypothetical protein  49.35 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0041853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4778  cupin 2 domain-containing protein  51.32 
 
 		 350 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2606  hypothetical protein  51.32 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1481  zinc finger CDGSH-type domain protein  51.95 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000532674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0808  hypothetical protein  49.38 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1927  zinc finger CDGSH-type domain protein  51.52 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0916  zinc finger CDGSH-type domain protein  53.62 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1000  Zinc finger, CDGSH-type  46.75 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1168  zinc finger CDGSH-type domain protein  48.53 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000181861 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0779  hypothetical protein  46.91 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1697  Zn-finger, CDGSH type  47.95 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.214083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3093  zinc finger CDGSH-type domain protein  50.77 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0104  zinc finger CDGSH-type domain protein  40.85 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0099  Zn-finger, CDGSH type  43.06 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.15953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40.58 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.273189  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2662  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  42.86 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00723724  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0138  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.65 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0126  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.86 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000192409  decreased coverage  0.000678625 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  59.38 
 
 		 466 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3413  hypothetical protein  32.84 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.979804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0205071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>