34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1719 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1719  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  100 
 
 		 79 aa  163  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.703607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2171  hypothetical protein  89.61 
 
 		 93 aa  147  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00528546  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3396  Zinc finger, CDGSH-type  58.97 
 
 		 79 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0430  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  57.14 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.95 
 
 		 502 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3910  zinc finger CDGSH-type domain protein  66.18 
 
 		 82 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50 
 
 		 516 aa  94.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0957  zinc finger CDGSH-type domain protein  59.72 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.28 
 
 		 516 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.72 
 
 		 516 aa  94.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4778  cupin 2 domain-containing protein  52.56 
 
 		 350 aa  94.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2606  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1679  zinc finger CDGSH-type domain protein  46.15 
 
 		 79 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  47.44 
 
 		 515 aa  87.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.05 
 
 		 514 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  47.06 
 
 		 518 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1481  zinc finger CDGSH-type domain protein  47.44 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000532674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.35 
 
 		 510 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0862  hypothetical protein  44.87 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0041853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0808  hypothetical protein  55.07 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0916  zinc finger CDGSH-type domain protein  52.94 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0779  hypothetical protein  53.62 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1927  zinc finger CDGSH-type domain protein  49.23 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1168  zinc finger CDGSH-type domain protein  44.44 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000181861 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0104  zinc finger CDGSH-type domain protein  41.79 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3093  zinc finger CDGSH-type domain protein  47.06 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193762  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1697  Zn-finger, CDGSH type  41.43 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.214083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0099  Zn-finger, CDGSH type  44.78 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.15953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0138  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.42 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2662  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  43.48 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00723724  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1000  Zinc finger, CDGSH-type  38.36 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  39.71 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.273189  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0126  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.68 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000192409  decreased coverage  0.000678625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3413  hypothetical protein  30.26 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.979804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>