26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3413 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3413  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  181  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.979804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1355  hypothetical protein  64.1 
 
 		 92 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0205071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15750  hypothetical protein  61.54 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041417 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  35.29 
 
 		 518 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1697  Zn-finger, CDGSH type  31.87 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.214083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0957  zinc finger CDGSH-type domain protein  32.84 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1679  zinc finger CDGSH-type domain protein  34.43 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3396  Zinc finger, CDGSH-type  33.87 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4778  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 350 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3910  zinc finger CDGSH-type domain protein  34.33 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.87 
 
 		 502 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0916  zinc finger CDGSH-type domain protein  35.53 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1168  zinc finger CDGSH-type domain protein  33.78 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000181861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.84 
 
 		 516 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0808  hypothetical protein  29.85 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  31.25 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.273189  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1719  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  30.26 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.703607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0779  hypothetical protein  28.36 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32 
 
 		 514 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3093  zinc finger CDGSH-type domain protein  36.23 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2662  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  34.85 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00723724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  30.43 
 
 		 515 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0099  Zn-finger, CDGSH type  35.21 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.15953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 516 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.85 
 
 		 516 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0430  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  29.58 
 
 		 79 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>