36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1168 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1168  zinc finger CDGSH-type domain protein  100 
 
 		 77 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000181861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3093  zinc finger CDGSH-type domain protein  92.21 
 
 		 76 aa  146  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0916  zinc finger CDGSH-type domain protein  71.88 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0862  hypothetical protein  50.72 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0041853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.25 
 
 		 510 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1927  zinc finger CDGSH-type domain protein  62.3 
 
 		 82 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3396  Zinc finger, CDGSH-type  53.33 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.33 
 
 		 502 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1679  zinc finger CDGSH-type domain protein  55.07 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1481  zinc finger CDGSH-type domain protein  45.45 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000532674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  54.39 
 
 		 515 aa  73.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0957  zinc finger CDGSH-type domain protein  48.53 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50 
 
 		 516 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1719  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  44.44 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.703607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3910  zinc finger CDGSH-type domain protein  50 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0099  Zn-finger, CDGSH type  45.45 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.15953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  45.59 
 
 		 518 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.53 
 
 		 516 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.53 
 
 		 516 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1697  Zn-finger, CDGSH type  41.1 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.214083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.06 
 
 		 514 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2171  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00528546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0430  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  42.67 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2662  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  47.62 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2606  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223152 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0104  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.19 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  42.19 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.273189  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0808  hypothetical protein  52.31 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0138  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.19 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0779  hypothetical protein  50.77 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4778  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0126  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.5 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000192409  decreased coverage  0.000678625 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1000  Zinc finger, CDGSH-type  42.59 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15750  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1355  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0205071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3413  hypothetical protein  33.78 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.979804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>