25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1855 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1855  amidohydrolase 2  100 
 
 
373 aa  771    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0785916  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0202  amidohydrolase 2  55.83 
 
 
375 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0402024  normal  0.174802 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3285  hypothetical protein  41.4 
 
 
376 aa  300  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0165646 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  33.09 
 
 
865 aa  212  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0314  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
384 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7850  hypothetical protein  29.26 
 
 
385 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0172  amidohydrolase 2  32.92 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3983  hypothetical protein  27.08 
 
 
386 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0363  amidohydrolase 2  31.86 
 
 
339 aa  143  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0638022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6503  amidohydrolase 2  33.76 
 
 
407 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.286246  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2917  amidohydrolase 2  31.35 
 
 
392 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0241  amidohydrolase 2  31.56 
 
 
391 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.924171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0231  amidohydrolase 2  31.56 
 
 
391 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0221  amidohydrolase 2  31.3 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284859  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1965  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5785  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
363 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4953  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3318  amidohydrolase 2  30.41 
 
 
368 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.968016  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11907  hypothetical protein  33.46 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0988  amidohydrolase 2  28.07 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  30.83 
 
 
289 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  33.6 
 
 
287 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  31.25 
 
 
295 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  32 
 
 
291 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>