22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4953 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4953  amidohydrolase 2  100 
 
 
456 aa  950    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1855  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
373 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0785916  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0363  amidohydrolase 2  27 
 
 
339 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0638022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0202  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
375 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0402024  normal  0.174802 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3285  hypothetical protein  25.98 
 
 
376 aa  103  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0165646 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  23.61 
 
 
865 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7850  hypothetical protein  28.83 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1965  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3983  hypothetical protein  29.31 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5785  amidohydrolase 2  28.71 
 
 
363 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3318  amidohydrolase 2  25 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.968016  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0172  amidohydrolase 2  29.49 
 
 
391 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0314  amidohydrolase 2  28.85 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384708  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0241  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.924171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0231  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0221  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
391 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284859  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2917  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
392 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6503  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
407 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.286246  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11907  hypothetical protein  22.81 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0988  amidohydrolase 2  26.9 
 
 
432 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
338 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
348 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>