20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1965 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1965  amidohydrolase 2  100 
 
 
391 aa  748    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7850  hypothetical protein  42.06 
 
 
385 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0314  amidohydrolase 2  39.95 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3983  hypothetical protein  38.11 
 
 
386 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0231  amidohydrolase 2  39.21 
 
 
391 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0241  amidohydrolase 2  39.21 
 
 
391 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.924171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0221  amidohydrolase 2  39.21 
 
 
391 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284859  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2917  amidohydrolase 2  36.77 
 
 
392 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11907  hypothetical protein  36.29 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6503  amidohydrolase 2  38.89 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.286246  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5785  amidohydrolase 2  41.69 
 
 
363 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0172  amidohydrolase 2  39.13 
 
 
391 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3318  amidohydrolase 2  37.2 
 
 
368 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.968016  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3285  hypothetical protein  34.46 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0165646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1855  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
373 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0785916  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0202  amidohydrolase 2  34.54 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0402024  normal  0.174802 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  32.16 
 
 
865 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0363  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
339 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0638022  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4953  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0988  amidohydrolase 2  28.44 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>