19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11907 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11907  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  768    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3318  amidohydrolase 2  65.85 
 
 
368 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.968016  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7850  hypothetical protein  44.04 
 
 
385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0172  amidohydrolase 2  48.07 
 
 
391 aa  305  7e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0221  amidohydrolase 2  45.04 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284859  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2917  amidohydrolase 2  44.92 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0231  amidohydrolase 2  44.77 
 
 
391 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0241  amidohydrolase 2  44.77 
 
 
391 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.924171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3983  hypothetical protein  43.27 
 
 
386 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0314  amidohydrolase 2  41.24 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384708  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6503  amidohydrolase 2  42.9 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.286246  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5785  amidohydrolase 2  42.35 
 
 
363 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1965  amidohydrolase 2  36.29 
 
 
391 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172062  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3285  hypothetical protein  34.54 
 
 
376 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0165646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0202  amidohydrolase 2  38 
 
 
375 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0402024  normal  0.174802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1855  amidohydrolase 2  33.46 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0785916  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  31.17 
 
 
865 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0363  amidohydrolase 2  26.5 
 
 
339 aa  99.4  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0638022  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4953  amidohydrolase 2  22.81 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>