19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0314 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0314  amidohydrolase 2  100 
 
 		 384 aa  769    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6503  amidohydrolase 2  70.16 
 
 		 407 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.286246  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3983  hypothetical protein  47.64 
 
 		 386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7850  hypothetical protein  47.28 
 
 		 385 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5785  amidohydrolase 2  52.72 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0172  amidohydrolase 2  47.97 
 
 		 391 aa  288  8e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2917  amidohydrolase 2  45.82 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  0.11584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0221  amidohydrolase 2  43.01 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284859  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0231  amidohydrolase 2  42.74 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0241  amidohydrolase 2  42.74 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.924171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11907  hypothetical protein  41.24 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3318  amidohydrolase 2  41.62 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.968016  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1965  amidohydrolase 2  38.95 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172062  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3285  hypothetical protein  32.72 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0165646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1855  amidohydrolase 2  30.67 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0785916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0202  amidohydrolase 2  33.6 
 
 		 375 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0402024  normal  0.174802 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  27.74 
 
 		 865 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0363  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0638022  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4953  amidohydrolase 2  28.85 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>