46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4340 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  345  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  27.11 
 
 
225 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  28.31 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0275  hypothetical protein  33.55 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274335  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0294  hypothetical protein  33.55 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0284  hypothetical protein  33.55 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  29.85 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  29.05 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  29.05 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  30.66 
 
 
300 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  26.22 
 
 
244 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  28.24 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  30.97 
 
 
215 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  27.78 
 
 
166 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  28.38 
 
 
299 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  27.78 
 
 
182 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  25.83 
 
 
221 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  25.83 
 
 
221 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  25.83 
 
 
221 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  25.83 
 
 
221 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  25.83 
 
 
221 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  25.66 
 
 
261 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  28.89 
 
 
213 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  28.89 
 
 
213 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  28.89 
 
 
216 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  28.35 
 
 
325 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1077  hypothetical protein  28.18 
 
 
200 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  26.47 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  28.47 
 
 
164 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  28.47 
 
 
164 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  27.16 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 
209 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 
209 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  25.16 
 
 
209 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  25.81 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  27.74 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2860  hypothetical protein  28.76 
 
 
225 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11297  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3132  hypothetical protein  24.69 
 
 
281 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2554  hypothetical protein  26.7 
 
 
447 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00704002  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  25.97 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1498  hypothetical protein  25.42 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6629  hypothetical protein  26.79 
 
 
297 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000250395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  25.38 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  30.56 
 
 
213 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>