36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2818 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  357  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  29.68 
 
 
299 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  29.03 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  29.03 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0275  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0284  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0294  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  27.59 
 
 
295 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  28.79 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  30.3 
 
 
300 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  29.23 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  27.67 
 
 
261 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  27.17 
 
 
215 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1174  hypothetical protein  29.12 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.147447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  29.66 
 
 
216 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  29.66 
 
 
213 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  29.66 
 
 
213 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  25.29 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  25.29 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  25.29 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  25.29 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  25.29 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  25.29 
 
 
244 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  26.9 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  23.85 
 
 
225 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  24.86 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  28.04 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  25.74 
 
 
164 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  24.86 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  25.74 
 
 
164 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  24.57 
 
 
202 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  25.74 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6629  hypothetical protein  29.09 
 
 
297 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000250395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1077  hypothetical protein  19.44 
 
 
200 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2554  hypothetical protein  23.26 
 
 
447 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00704002  normal  0.120688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>