31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2554 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2554  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  881    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00704002  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1175  hypothetical protein  43.51 
 
 
256 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.095468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2974  Heat shock protein 70  31.44 
 
 
473 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458744  normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3675  Heat shock protein 70  43.27 
 
 
698 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201192  normal  0.0422878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  40.15 
 
 
658 aa  70.1  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  30.68 
 
 
209 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  28.37 
 
 
380 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0710  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.24 
 
 
270 aa  57  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  33.33 
 
 
858 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  28.83 
 
 
215 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  29.44 
 
 
597 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0643  chaperone protein HscA  33.81 
 
 
355 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  33 
 
 
213 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  34.72 
 
 
657 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  30.46 
 
 
632 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  35.2 
 
 
631 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1937  molecular chaperone  39.53 
 
 
245 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0143753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  34.4 
 
 
632 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  27.52 
 
 
164 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 
209 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  27.52 
 
 
164 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2817  hypothetical protein  24.56 
 
 
228 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.38321  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 
209 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 
209 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0558  molecular chaperone-like protein  54.76 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  31.75 
 
 
649 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  31.82 
 
 
640 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  35.14 
 
 
816 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  25.23 
 
 
325 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  27.1 
 
 
164 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>