48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4164 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  97.56 
 
 
216 aa  359  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  55.51 
 
 
225 aa  224  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  65.43 
 
 
244 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  61.36 
 
 
202 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  49.76 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  53.59 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  49.28 
 
 
221 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  49.28 
 
 
221 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  49.28 
 
 
221 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  52.9 
 
 
191 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  50.31 
 
 
182 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  50.31 
 
 
166 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  43.4 
 
 
200 aa  134  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  35.75 
 
 
295 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  33.63 
 
 
299 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  37.01 
 
 
261 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  32.69 
 
 
289 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  32.69 
 
 
289 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  33.57 
 
 
300 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2860  hypothetical protein  33.12 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11297  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  30.68 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  30.24 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0275  hypothetical protein  31.1 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0284  hypothetical protein  31.1 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0294  hypothetical protein  31.1 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  29.78 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  30.61 
 
 
325 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10201  hypothetical protein  27.01 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0482433  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  29.23 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  27.17 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4994  hypothetical protein  30.2 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3789  hypothetical protein  30.36 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.229769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0470  hypothetical protein  25.97 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  0.102326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1077  hypothetical protein  28.22 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0185  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  23.04 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  24.84 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0167  hypothetical protein  22.36 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  24.84 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0158  hypothetical protein  22.36 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0148  hypothetical protein  21.74 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6629  hypothetical protein  26 
 
 
297 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000250395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09300  hypothetical protein  26.55 
 
 
171 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307281  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4699  hypothetical protein  25.66 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4611  hypothetical protein  25.66 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>