52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3653 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
209 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
209 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  97.13 
 
 
209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  65.66 
 
 
209 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4131  twin-arginine translocation pathway signal  57.6 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11393  hypothetical protein  56.21 
 
 
220 aa  175  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4528  hypothetical protein  47.93 
 
 
167 aa  141  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0611713  normal  0.470982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0285  hypothetical protein  47.59 
 
 
162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0276  hypothetical protein  47.59 
 
 
162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.665585  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0295  hypothetical protein  47.59 
 
 
162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2861  hypothetical protein  43.72 
 
 
178 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  33.16 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  33.66 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  33.66 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  33.66 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12004  MCE associated membrane protein  44.17 
 
 
160 aa  94  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000034747  normal  0.767269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0918  hypothetical protein  41.44 
 
 
185 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  32.32 
 
 
205 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  32.32 
 
 
205 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2108  hypothetical protein  42.28 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540206  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4597  hypothetical protein  40.65 
 
 
267 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0645  hypothetical protein  35.77 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1685  hypothetical protein  35.77 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0520  hypothetical protein  35.77 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1661  hypothetical protein  35.77 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1634  hypothetical protein  35.77 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  25.31 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  24.69 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  27.78 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  27.95 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  26.77 
 
 
171 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  28.49 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0702  hypothetical protein  29.79 
 
 
309 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13526  MCE associated protein  25.45 
 
 
160 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000919323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0710  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.1 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  23.75 
 
 
225 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1174  hypothetical protein  24.87 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.147447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3786  hypothetical protein  29.79 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0700832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2554  hypothetical protein  30.28 
 
 
447 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00704002  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  26.12 
 
 
325 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0143  hypothetical protein  30.94 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  26.61 
 
 
175 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3132  hypothetical protein  31.58 
 
 
281 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10179  MCE associated membrane protein  31.36 
 
 
244 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0127  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  23.02 
 
 
216 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0136  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  23.02 
 
 
213 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  23.02 
 
 
213 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0117  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>