27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3789 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3789  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  384  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.229769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  32.56 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  31.41 
 
 
289 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  30.49 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  31.41 
 
 
299 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  31.41 
 
 
289 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  36.63 
 
 
261 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  30.94 
 
 
300 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  29.76 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  29.76 
 
 
166 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  30.59 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  32.33 
 
 
191 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  35.58 
 
 
221 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  28.24 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  27.17 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  34.95 
 
 
221 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  34.95 
 
 
221 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  34.95 
 
 
221 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  34.95 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  28.09 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  31.73 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  31.73 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  31.73 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2860  hypothetical protein  26.88 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11297  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0275  hypothetical protein  26.97 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274335  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0294  hypothetical protein  26.97 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0284  hypothetical protein  26.97 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>