42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12003 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  100 
 
 
191 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  57.58 
 
 
244 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  54.37 
 
 
202 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  50.55 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  54.43 
 
 
221 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  54.14 
 
 
221 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  54.14 
 
 
221 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  54.14 
 
 
221 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  54.14 
 
 
221 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  54.07 
 
 
216 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  54.07 
 
 
213 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  54.07 
 
 
213 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  45.83 
 
 
182 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  46.39 
 
 
166 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  46.2 
 
 
200 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  36.13 
 
 
289 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  36.13 
 
 
289 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  34.84 
 
 
299 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  34.84 
 
 
295 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  33.97 
 
 
261 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0275  hypothetical protein  36.53 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0284  hypothetical protein  36.53 
 
 
209 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0294  hypothetical protein  36.53 
 
 
209 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  32.37 
 
 
300 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2860  hypothetical protein  35.29 
 
 
225 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11297  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  30.82 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  32.76 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  29.46 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  29.23 
 
 
176 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  29.11 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  28.96 
 
 
213 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3789  hypothetical protein  32.33 
 
 
196 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.229769  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  28.3 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10178  MCE associated protein  26.4 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  26.14 
 
 
205 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  26.14 
 
 
205 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4994  hypothetical protein  26.06 
 
 
229 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0470  hypothetical protein  25.19 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  0.102326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0185  hypothetical protein  24.06 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  26.46 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  26.46 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  26.46 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>