45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3654 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  93.65 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  54.81 
 
 
295 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  56.03 
 
 
300 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  58.97 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0275  hypothetical protein  56.8 
 
 
209 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0284  hypothetical protein  56.8 
 
 
209 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0294  hypothetical protein  56.8 
 
 
209 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2860  hypothetical protein  52.23 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11297  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  45.93 
 
 
179 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  35.03 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  33.67 
 
 
225 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  37.34 
 
 
182 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  33.14 
 
 
221 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  37.34 
 
 
166 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  34.13 
 
 
244 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  32.76 
 
 
221 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  32.76 
 
 
221 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  32.76 
 
 
221 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  32.76 
 
 
221 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  38.4 
 
 
191 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  32.61 
 
 
213 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  32.61 
 
 
216 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  32.61 
 
 
213 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  30.77 
 
 
200 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  28 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  29.37 
 
 
175 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  27.85 
 
 
215 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3789  hypothetical protein  30.22 
 
 
196 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.229769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  27.94 
 
 
325 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  28.36 
 
 
213 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6629  hypothetical protein  31.63 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000250395  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4994  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4699  hypothetical protein  26.24 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4611  hypothetical protein  26.24 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0117  hypothetical protein  28.26 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10201  hypothetical protein  21.92 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0482433  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  24.53 
 
 
223 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1077  hypothetical protein  28.83 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0470  hypothetical protein  22.67 
 
 
204 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  0.102326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  26.92 
 
 
206 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  26.92 
 
 
206 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  26.92 
 
 
206 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0148  hypothetical protein  21.52 
 
 
200 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>