28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1077 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1077  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  33.13 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  33.13 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  29.46 
 
 
175 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  28.66 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  26.51 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  28.66 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  28.66 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  28.66 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  28.83 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  29.38 
 
 
295 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  26.49 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  26.99 
 
 
244 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  28.19 
 
 
289 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  28.19 
 
 
289 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  24.54 
 
 
223 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  27.21 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  30.77 
 
 
179 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  25.64 
 
 
261 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  29.14 
 
 
299 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  29.36 
 
 
213 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  22.09 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  25.64 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  27.48 
 
 
325 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  25.9 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  25.9 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  25.9 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  28.14 
 
 
200 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>