44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1553 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  334  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  333  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  51.83 
 
 
244 aa  175  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  50.61 
 
 
225 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  53.55 
 
 
202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  50.97 
 
 
221 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  50.64 
 
 
221 aa  158  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  50.97 
 
 
221 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  50.97 
 
 
221 aa  158  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  50.97 
 
 
221 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  54.74 
 
 
213 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  54.74 
 
 
216 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  54.74 
 
 
213 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  51.49 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  44.51 
 
 
200 aa  141  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  37.01 
 
 
261 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  37.34 
 
 
299 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  37.34 
 
 
289 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  37.34 
 
 
289 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  33.12 
 
 
295 aa  101  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  35.29 
 
 
300 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  33.56 
 
 
179 aa  84  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2860  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11297  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0275  hypothetical protein  34.19 
 
 
209 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0284  hypothetical protein  34.19 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0294  hypothetical protein  34.19 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  29.63 
 
 
325 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  29.87 
 
 
215 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  30 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1077  hypothetical protein  31.85 
 
 
200 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  26.06 
 
 
223 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3789  hypothetical protein  29.51 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.229769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4994  hypothetical protein  25.5 
 
 
229 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1174  hypothetical protein  25.45 
 
 
197 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.147447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  28.67 
 
 
213 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6629  hypothetical protein  33.68 
 
 
297 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000250395  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4611  hypothetical protein  26.09 
 
 
227 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4699  hypothetical protein  26.09 
 
 
227 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09300  hypothetical protein  28.44 
 
 
171 aa  47.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307281  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  24.86 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  25.77 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13527  MCE associated alanine and valine rich protein  25.22 
 
 
242 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000477815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5196  hypothetical protein  24.77 
 
 
225 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.14833  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10201  hypothetical protein  25.48 
 
 
219 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0482433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>