47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11394 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  57.42 
 
 
299 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  59.62 
 
 
289 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  59.62 
 
 
289 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  61.7 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  54.07 
 
 
295 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0275  hypothetical protein  48.5 
 
 
209 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0284  hypothetical protein  48.5 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0294  hypothetical protein  48.5 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  39.35 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  39.35 
 
 
244 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  40.25 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2860  hypothetical protein  42.48 
 
 
225 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11297  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  37.23 
 
 
221 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  36.9 
 
 
221 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  36.9 
 
 
221 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  36.9 
 
 
221 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  36.9 
 
 
221 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  37.01 
 
 
182 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  37.01 
 
 
166 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  37.84 
 
 
179 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  36.23 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  36.23 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  36.8 
 
 
191 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  36.23 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  35.5 
 
 
200 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  29.19 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  28.12 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  28.31 
 
 
176 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3789  hypothetical protein  36.63 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.229769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4994  hypothetical protein  28.38 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4699  hypothetical protein  28.91 
 
 
227 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4611  hypothetical protein  28.91 
 
 
227 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  25.6 
 
 
175 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0185  hypothetical protein  27.56 
 
 
198 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6629  hypothetical protein  30.39 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000250395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1077  hypothetical protein  26.55 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  25.56 
 
 
164 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0470  hypothetical protein  25.32 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  0.102326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10201  hypothetical protein  22.58 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0482433  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0705  putative MCE associated membrane protein  35.35 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5196  hypothetical protein  27.35 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.14833  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0135  hypothetical protein  30.23 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.247446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0126  hypothetical protein  30.23 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10178  MCE associated protein  28.21 
 
 
184 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0140  putative MCE associated membrane protein  33.33 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>