18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6629 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6629  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  562  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000250395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09300  hypothetical protein  41.5 
 
 
171 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307281  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03780  hypothetical protein  28.74 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.712434  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  28.72 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  28.72 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  28.72 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  28.72 
 
 
221 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  28.72 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  32.14 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  32.14 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  27.43 
 
 
215 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  31.25 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  33.68 
 
 
182 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  33.68 
 
 
166 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  24.03 
 
 
202 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  30.39 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  25.68 
 
 
244 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  26.79 
 
 
175 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>