32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3943 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  31.14 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  31.14 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  31.14 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  27.33 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  27.33 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  29.34 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  26.63 
 
 
164 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  30.94 
 
 
325 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  31.11 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2108  hypothetical protein  30.77 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540206  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  26.06 
 
 
166 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  26.06 
 
 
182 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  24.64 
 
 
164 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  24.64 
 
 
164 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  29.59 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2554  hypothetical protein  30 
 
 
447 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00704002  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0117  hypothetical protein  23.18 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13526  MCE associated protein  25.97 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000919323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6628  hypothetical protein  31.82 
 
 
371 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00676628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09290  hypothetical protein  28.04 
 
 
165 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0136  hypothetical protein  23.18 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0127  hypothetical protein  23.18 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  24.44 
 
 
164 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  26.42 
 
 
164 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  23.42 
 
 
289 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  23.42 
 
 
289 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  26.09 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3132  hypothetical protein  25.9 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  26.81 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  24.22 
 
 
299 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4597  hypothetical protein  26.45 
 
 
267 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>