42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2108 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2108  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  460  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540206  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4597  hypothetical protein  73.6 
 
 
267 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  53.64 
 
 
230 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  53.57 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  53.57 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  53.57 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  49.47 
 
 
205 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  49.47 
 
 
205 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12004  MCE associated membrane protein  59.17 
 
 
160 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000034747  normal  0.767269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0645  hypothetical protein  51.09 
 
 
219 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1685  hypothetical protein  51.09 
 
 
219 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0520  hypothetical protein  51.09 
 
 
219 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0918  hypothetical protein  49.09 
 
 
185 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1634  hypothetical protein  51.09 
 
 
219 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1661  hypothetical protein  51.09 
 
 
219 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  41.15 
 
 
209 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11393  hypothetical protein  34.73 
 
 
220 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  36.72 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  36.72 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  37.13 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0276  hypothetical protein  47.37 
 
 
162 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.665585  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0285  hypothetical protein  47.37 
 
 
162 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0295  hypothetical protein  47.37 
 
 
162 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4131  twin-arginine translocation pathway signal  37.87 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4528  hypothetical protein  43.12 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0611713  normal  0.470982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2861  hypothetical protein  37.61 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383968  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  29.88 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  30.84 
 
 
164 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  30.84 
 
 
164 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13526  MCE associated protein  26.99 
 
 
160 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000919323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  30.84 
 
 
164 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09290  hypothetical protein  35.29 
 
 
165 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  23.98 
 
 
164 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  26.17 
 
 
164 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0127  hypothetical protein  28.8 
 
 
317 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0136  hypothetical protein  28.8 
 
 
317 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0117  hypothetical protein  28.8 
 
 
315 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0702  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  27.37 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0143  hypothetical protein  30.23 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  29.41 
 
 
213 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>