42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12004 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12004  MCE associated membrane protein  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000034747  normal  0.767269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  61.88 
 
 
230 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  51.92 
 
 
205 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  51.92 
 
 
205 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  51.25 
 
 
206 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  51.25 
 
 
206 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  51.25 
 
 
206 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2108  hypothetical protein  60.95 
 
 
235 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540206  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0918  hypothetical protein  55.19 
 
 
185 aa  157  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1685  hypothetical protein  54.43 
 
 
219 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0645  hypothetical protein  54.43 
 
 
219 aa  147  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0520  hypothetical protein  54.43 
 
 
219 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1661  hypothetical protein  54.43 
 
 
219 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1634  hypothetical protein  54.43 
 
 
219 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4597  hypothetical protein  58.08 
 
 
267 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11393  hypothetical protein  49.57 
 
 
220 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  46.9 
 
 
209 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  38.96 
 
 
209 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  38.96 
 
 
209 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  37.2 
 
 
209 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4131  twin-arginine translocation pathway signal  45.13 
 
 
227 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0276  hypothetical protein  42.98 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.665585  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0285  hypothetical protein  42.98 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0295  hypothetical protein  42.98 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4528  hypothetical protein  41.28 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0611713  normal  0.470982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  28.99 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  28.99 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2861  hypothetical protein  39.81 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383968  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13526  MCE associated protein  25.32 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000919323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  27.54 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  23.61 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  22.22 
 
 
164 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09290  hypothetical protein  31.86 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  25.85 
 
 
223 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0702  hypothetical protein  31.09 
 
 
309 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3786  hypothetical protein  25.78 
 
 
198 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0700832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  31.3 
 
 
171 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  26.95 
 
 
213 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0710  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.91 
 
 
270 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  25.48 
 
 
215 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0143  hypothetical protein  31.03 
 
 
265 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  27.94 
 
 
325 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>