26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5195 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  337  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  84.76 
 
 
164 aa  293  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  63.41 
 
 
164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  63.41 
 
 
164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  62.2 
 
 
164 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13526  MCE associated protein  59.49 
 
 
160 aa  191  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000919323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  31.29 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  28.05 
 
 
206 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  28.05 
 
 
206 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  28.05 
 
 
206 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  24.69 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  28.4 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  24.69 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  24.07 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  23.18 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  23.18 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4528  hypothetical protein  25.93 
 
 
167 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0611713  normal  0.470982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0918  hypothetical protein  27.36 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4131  twin-arginine translocation pathway signal  26.85 
 
 
227 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11393  hypothetical protein  28.44 
 
 
220 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4597  hypothetical protein  28.97 
 
 
267 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  26.42 
 
 
223 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2108  hypothetical protein  27.72 
 
 
235 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540206  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  24.06 
 
 
325 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  26.39 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  25.6 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>