50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1531 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  46.63 
 
 
230 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  46.15 
 
 
206 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  46.15 
 
 
206 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  46.15 
 
 
206 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0918  hypothetical protein  48.05 
 
 
185 aa  141  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12004  MCE associated membrane protein  51.92 
 
 
160 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000034747  normal  0.767269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4597  hypothetical protein  46.12 
 
 
267 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2108  hypothetical protein  53.33 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540206  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0645  hypothetical protein  47.74 
 
 
219 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1634  hypothetical protein  47.74 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1685  hypothetical protein  47.74 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0520  hypothetical protein  47.74 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1661  hypothetical protein  47.74 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  33.81 
 
 
209 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 
209 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 
209 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0276  hypothetical protein  46.79 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.665585  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0285  hypothetical protein  46.79 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0295  hypothetical protein  46.79 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11393  hypothetical protein  40.37 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4131  twin-arginine translocation pathway signal  42.2 
 
 
227 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4528  hypothetical protein  38.89 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0611713  normal  0.470982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  27.33 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  29.2 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  29.2 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13526  MCE associated protein  25.97 
 
 
160 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000919323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  29.93 
 
 
164 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2861  hypothetical protein  37.04 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383968  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  23.18 
 
 
164 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09290  hypothetical protein  35.45 
 
 
165 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  23.18 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  31.2 
 
 
171 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  26.94 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  28.26 
 
 
221 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  28.26 
 
 
221 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  28.26 
 
 
221 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  28.26 
 
 
221 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  28.26 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  25.68 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0710  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.41 
 
 
270 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3786  hypothetical protein  38.27 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0700832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  31.37 
 
 
325 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0127  hypothetical protein  29.91 
 
 
317 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0136  hypothetical protein  29.91 
 
 
317 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2554  hypothetical protein  34.62 
 
 
447 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00704002  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  26.06 
 
 
191 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0117  hypothetical protein  29.91 
 
 
315 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>