35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1078 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  343  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  36.09 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  29.38 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  29.38 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  29.38 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  29.33 
 
 
205 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  29.33 
 
 
205 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  25.79 
 
 
209 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  25.79 
 
 
209 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 
209 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3943  hypothetical protein  31.11 
 
 
223 aa  53.9  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.995797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  27.68 
 
 
209 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  30.83 
 
 
295 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11393  hypothetical protein  28.18 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  29.01 
 
 
164 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2817  hypothetical protein  30.58 
 
 
228 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.38321  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  26.67 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  26.67 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0710  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.53 
 
 
270 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  24.38 
 
 
215 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0918  hypothetical protein  31.82 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  28.21 
 
 
230 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4131  twin-arginine translocation pathway signal  29.25 
 
 
227 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  30.43 
 
 
300 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  24.54 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4528  hypothetical protein  27.52 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0611713  normal  0.470982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1175  hypothetical protein  27.41 
 
 
256 aa  44.3  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.095468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  28.57 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  25.38 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  27.01 
 
 
244 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2554  hypothetical protein  24.7 
 
 
447 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00704002  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  28.24 
 
 
261 aa  40.8  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>