41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4528 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4528  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  327  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0611713  normal  0.470982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2861  hypothetical protein  77.11 
 
 
178 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0276  hypothetical protein  56.6 
 
 
162 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.665585  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0285  hypothetical protein  56.6 
 
 
162 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0295  hypothetical protein  56.6 
 
 
162 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  47.93 
 
 
209 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  47.93 
 
 
209 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  47.34 
 
 
209 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11393  hypothetical protein  47.88 
 
 
220 aa  143  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  49.03 
 
 
209 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4131  twin-arginine translocation pathway signal  52.17 
 
 
227 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2108  hypothetical protein  40.91 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540206  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  35.67 
 
 
205 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  35.67 
 
 
205 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  39.5 
 
 
230 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4597  hypothetical protein  43.44 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12004  MCE associated membrane protein  40.83 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000034747  normal  0.767269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  33.97 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  33.97 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  33.97 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0918  hypothetical protein  35.51 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0520  hypothetical protein  38.98 
 
 
219 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1685  hypothetical protein  38.98 
 
 
219 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1634  hypothetical protein  38.98 
 
 
219 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1661  hypothetical protein  38.98 
 
 
219 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0645  hypothetical protein  38.98 
 
 
219 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4698  hypothetical protein  28.35 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4610  hypothetical protein  28.35 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5195  hypothetical protein  23.9 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226765  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  24.32 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4993  hypothetical protein  28.7 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09290  hypothetical protein  28.83 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0710  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.16 
 
 
270 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3786  hypothetical protein  27.54 
 
 
198 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0700832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  27.56 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  28.89 
 
 
322 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2817  hypothetical protein  30.65 
 
 
228 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.38321  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13526  MCE associated protein  25.38 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000919323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0186  putative transmembrane protein  32.54 
 
 
229 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0469  putative transmembrane protein  37.31 
 
 
229 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0553533  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1174  hypothetical protein  20 
 
 
197 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.147447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>