More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1787 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1787  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 506 aa  1043    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0653231 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19754  predicted protein  57.41 
 
 		 563 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1282  amidophosphoribosyltransferase  54.66 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.734228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1671  amidophosphoribosyltransferase  55.99 
 
 		 503 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.735528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1692  amidophosphoribosyltransferase  55.67 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0936  amidophosphoribosyltransferase  53.4 
 
 		 511 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1902  amidophosphoribosyltransferase  53.55 
 
 		 501 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1103  amidophosphoribosyltransferase  54.45 
 
 		 511 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1267  amidophosphoribosyltransferase  54.32 
 
 		 506 aa  535  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0479924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1153  amidophosphoribosyltransferase  53.93 
 
 		 506 aa  535  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0456137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2000  amidophosphoribosyltransferase  53.54 
 
 		 501 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3811  amidophosphoribosyltransferase  53.74 
 
 		 502 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1561  amidophosphoribosyltransferase  52.93 
 
 		 501 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183865  normal  0.29049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3761  amidophosphoribosyltransferase  53.54 
 
 		 501 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1534  amidophosphoribosyltransferase  53.54 
 
 		 501 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.609043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1242  amidophosphoribosyltransferase  53.86 
 
 		 504 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.520504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1668  amidophosphoribosyltransferase  53.54 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.416229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1798  amidophosphoribosyltransferase  52.99 
 
 		 504 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2072  amidophosphoribosyltransferase  51.88 
 
 		 504 aa  529  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.729582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002879  amidophosphoribosyltransferase  54.24 
 
 		 504 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34150  amidophosphoribosyltransferase  53.91 
 
 		 501 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1471  amidophosphoribosyltransferase  55.76 
 
 		 505 aa  531  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2489  amidophosphoribosyltransferase  52.69 
 
 		 502 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2711  amidophosphoribosyltransferase  53.64 
 
 		 502 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.966551  normal  0.266296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1374  amidophosphoribosyltransferase  55.17 
 
 		 505 aa  528  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2550  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1259  amidophosphoribosyltransferase  53.13 
 
 		 503 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0525  amidophosphoribosyltransferase  53.72 
 
 		 504 aa  528  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2592  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.210187  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1906  amidophosphoribosyltransferase  55.99 
 
 		 506 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2504  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2713  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0617498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23920  amidophosphoribosyltransferase  53.75 
 
 		 501 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2793  amidophosphoribosyltransferase  55.35 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2604  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.841153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3328  amidophosphoribosyltransferase  54.64 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1552  amidophosphoribosyltransferase  53.21 
 
 		 507 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2025  amidophosphoribosyltransferase  53.75 
 
 		 501 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02237  amidophosphoribosyltransferase  53.81 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1344  amidophosphoribosyltransferase  53.81 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0463785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2468  amidophosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02197  hypothetical protein  53.81 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2130  amidophosphoribosyltransferase  53.86 
 
 		 511 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3452  amidophosphoribosyltransferase  53.81 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2606  amidophosphoribosyltransferase  53.81 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2861  amidophosphoribosyltransferase  54.23 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.272913  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1340  amidophosphoribosyltransferase  53.81 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.889803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2690  amidophosphoribosyltransferase  53.81 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0355  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 505 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1976  amidophosphoribosyltransferase  54.55 
 
 		 511 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399256  normal  0.224002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3064  amidophosphoribosyltransferase  54.15 
 
 		 504 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1535  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 505 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2463  amidophosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 505 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2302  amidophosphoribosyltransferase  52.81 
 
 		 504 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2460  amidophosphoribosyltransferase  53.46 
 
 		 510 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0352966  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1426  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 505 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1806  amidophosphoribosyltransferase  53.86 
 
 		 511 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1092  amidophosphoribosyltransferase  53.08 
 
 		 509 aa  519  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3798  amidophosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0808  amidophosphoribosyltransferase  52.99 
 
 		 503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02504  amidophosphoribosyltransferase  56.14 
 
 		 488 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1080  amidophosphoribosyltransferase  53.1 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1430  amidophosphoribosyltransferase  53.73 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1495  amidophosphoribosyltransferase  53.73 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.842806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03095  amidophosphoribosyltransferase  53.21 
 
 		 504 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2146  amidophosphoribosyltransferase  52.28 
 
 		 504 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3563  amidophosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 510 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2299  amidophosphoribosyltransferase  53.86 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2118  amidophosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775097  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2570  amidophosphoribosyltransferase  53.93 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1607  amidophosphoribosyltransferase  53.29 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1490  amidophosphoribosyltransferase  53.73 
 
 		 504 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00163594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4402  amidophosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 510 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2437  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0916  amidophosphoribosyltransferase  52.26 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3355  amidophosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0220372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3965  amidophosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 510 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1483  amidophosphoribosyltransferase  53.53 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3860  amidophosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3056  amidophosphoribosyltransferase  51.72 
 
 		 511 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4615  amidophosphoribosyltransferase  53.4 
 
 		 510 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.257725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4769  amidophosphoribosyltransferase  53.2 
 
 		 502 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573839  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1656  amidophosphoribosyltransferase  52.9 
 
 		 504 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00921285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1621  amidophosphoribosyltransferase  52.28 
 
 		 504 aa  508  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2683  amidophosphoribosyltransferase  52.88 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0812  amidophosphoribosyltransferase  54.03 
 
 		 488 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325292  normal  0.495942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2738  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 		 504 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1609  amidophosphoribosyltransferase  52.48 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1621  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.387036  normal  0.862121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1399  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 		 504 aa  511  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2755  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2832  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0762  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0686  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2300  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2874  amidophosphoribosyltransferase  51.19 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.352356 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2438  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1965  amidophosphoribosyltransferase  52.78 
 
 		 504 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.960535  normal  0.602914 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1328  amidophosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 502 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.159148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1865  amidophosphoribosyltransferase  52.16 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>