115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0415 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0415  dipeptidase, putative  100 
 
 
315 aa  647    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.283202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  27.91 
 
 
315 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  29.79 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0326  peptidase M19 renal dipeptidase  29.73 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  24.91 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  27.08 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  28.03 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  28.78 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  25.62 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  28.21 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  26.71 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  31.25 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  26.07 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  26.98 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  32.39 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  25 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  31.82 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  27.84 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  24.91 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  26.11 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  24.28 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.5 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  25.63 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  32.89 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  25.95 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  27.1 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  28.81 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  26.94 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  29.69 
 
 
350 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  26.34 
 
 
352 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  29.33 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  33.77 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  25 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  24 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  25.76 
 
 
353 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  26.81 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  31.64 
 
 
344 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.49 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  26.09 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  25.75 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  28.78 
 
 
399 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  27.63 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  28.35 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  29.94 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  28.3 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  30.99 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  25.68 
 
 
393 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  30 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  25.18 
 
 
345 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  26.92 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  23.05 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  26.92 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  29.83 
 
 
342 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  25.57 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  26.19 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.15 
 
 
400 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  30.43 
 
 
397 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2534  peptidase M19 renal dipeptidase  23.76 
 
 
331 aa  52.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2247  peptidase M19 renal dipeptidase  30.67 
 
 
330 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00766827  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  27.84 
 
 
355 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  24.86 
 
 
327 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  28.21 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  23.33 
 
 
390 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  29.02 
 
 
349 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  29.02 
 
 
349 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  27.84 
 
 
355 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  30.46 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  31.33 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4630  peptidase M19 renal dipeptidase  28.96 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  30.82 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  33.87 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  24.47 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  26.47 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  22.33 
 
 
399 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  29.14 
 
 
368 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  30 
 
 
413 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1112  peptidase M19, renal dipeptidase  29.86 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0274447  hitchhiker  0.0050668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  26.02 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  29.65 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  26.83 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  27.11 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  26.83 
 
 
388 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  26.83 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  26.83 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  26.42 
 
 
392 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  28.39 
 
 
399 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  25.29 
 
 
396 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  25.45 
 
 
438 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  22.96 
 
 
400 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  25.88 
 
 
388 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.22 
 
 
387 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  24.07 
 
 
388 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  19.71 
 
 
381 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  26.22 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  26.11 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>