More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0282 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0282  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
351 aa  700    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1656  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  34.91 
 
 
342 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1464  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.33 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3872  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  34.22 
 
 
348 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3788  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  34.22 
 
 
348 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1447  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  34.02 
 
 
344 aa  192  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.777873  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1694  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  32.06 
 
 
345 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3731  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3758  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.32 
 
 
337 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1817  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.61 
 
 
337 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.556225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1664  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.49 
 
 
340 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1166  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  32.39 
 
 
351 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2162  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.07 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3251  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.32 
 
 
349 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1937  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.03 
 
 
337 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1641  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  32.45 
 
 
342 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0465165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1907  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  30.87 
 
 
378 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123067  normal  0.0670629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4149  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  30.6 
 
 
378 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1929  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  31.18 
 
 
342 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00828619  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0474  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  31.62 
 
 
337 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0567  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.87 
 
 
378 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5119  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  32.08 
 
 
333 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1811  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  32.94 
 
 
334 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890434  normal  0.117686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4852  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.53 
 
 
334 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285444  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0334  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  34.31 
 
 
335 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2101  cyanide-insensitive terminal oxidase  34.41 
 
 
335 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1836  cyanide-insensitive terminal oxidase  34.41 
 
 
335 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0837  cyanide-insensitive terminal oxidase  34.41 
 
 
335 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2149  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  34.02 
 
 
335 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1128  cyanide-insensitive terminal oxidase  34.41 
 
 
335 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1211  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  29.19 
 
 
378 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0427  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  34.02 
 
 
335 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1516  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  30.57 
 
 
338 aa  153  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.475209  normal  0.900385 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1769  cyanide-insensitive terminal oxidase  34.02 
 
 
335 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3306  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  34.6 
 
 
335 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.167701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1695  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.29 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0476582  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02215  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  32.87 
 
 
339 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3592  Cytochrome bd type quinol oxidase subunit 2 protein  31.09 
 
 
334 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4650  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.97 
 
 
335 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0119  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  32.66 
 
 
341 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0803288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13040  CioB, cyanide insensitive terminal oxidase  30.03 
 
 
335 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1178  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.03 
 
 
335 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1270  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.61 
 
 
342 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019616  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4512  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.68 
 
 
335 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0560  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.35 
 
 
378 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3271  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.5 
 
 
335 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327803  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0728  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.35 
 
 
378 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3542  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.73 
 
 
384 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2869  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.08 
 
 
378 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3177  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.08 
 
 
378 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0544  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.08 
 
 
378 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.972567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0147  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.08 
 
 
378 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1442  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.08 
 
 
378 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3013  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.32 
 
 
342 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1205  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  28.93 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000808  putative Cytochrome bd2 subunit II  30.95 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4644  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.68 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39866  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5366  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.43 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4819  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.43 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3092  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.91 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582021  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0174  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  33.72 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4790  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.72 
 
 
335 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0699  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.9 
 
 
337 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425896  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5382  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.72 
 
 
335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5479  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.72 
 
 
335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779913  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.03 
 
 
336 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0942  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.03 
 
 
335 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1086  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.03 
 
 
335 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0511  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.45 
 
 
384 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0445  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  26.45 
 
 
384 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000388  putative Cytochrome bd2 subunit II  29.33 
 
 
335 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1311  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.09 
 
 
334 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6148  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  29.57 
 
 
378 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.638199  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2829  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.14 
 
 
378 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0453  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.22 
 
 
378 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1209  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.96 
 
 
343 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2204  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.1 
 
 
378 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113607  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2818  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.1 
 
 
378 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3117  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.41 
 
 
334 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4281  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  27.68 
 
 
335 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.207239  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6969  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  30.06 
 
 
335 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2736  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.53 
 
 
378 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554056  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0298  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.14 
 
 
378 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2878  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.03 
 
 
378 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0788  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.39 
 
 
335 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4892  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  28.24 
 
 
335 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3205  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.9 
 
 
341 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6191  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.52 
 
 
335 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2039  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.92 
 
 
341 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0255  hypothetical protein  31.79 
 
 
329 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11040  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  30.61 
 
 
335 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2650  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.48 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2640  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.97 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000254799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2096  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.78 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3857  hypothetical protein  28.82 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346842  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2978  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.5 
 
 
379 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000819855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3735  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.06 
 
 
382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.952197  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2992  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.5 
 
 
379 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2195  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.08 
 
 
341 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1385  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.5 
 
 
379 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>