24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10484 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  100 
 
 
87 aa  168  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  72.41 
 
 
93 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  70.11 
 
 
108 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0644  hypothetical protein  67.57 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0637  hypothetical protein  67.57 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102221  normal  0.0409068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0657  hypothetical protein  67.57 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0721883  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  48.24 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  46.91 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  47.73 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  41.77 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  42.17 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  36.84 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  41.18 
 
 
96 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  38.89 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  34.52 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  36.14 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  40.54 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  31.58 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  43.06 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  37.18 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  35.23 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  37.97 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  32.93 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  32.93 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>