18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0446 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  219  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  59.38 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  44.9 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  44.09 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  39.58 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  39.81 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  37.86 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  44.23 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3024  hypothetical protein  35.78 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  39.8 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  39.42 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  36.67 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  35.24 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  38.03 
 
 		 87 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03700  hypothetical protein  40.38 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00236427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>