24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4620 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  181  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  45.35 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  44.9 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  46.67 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  40.38 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  42.39 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  35.29 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  34.78 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  39.51 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  32.26 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  38.89 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  36 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  36.84 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  42.11 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  43.24 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  31.58 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  39.78 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  46.58 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  47.83 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  36.59 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  40.62 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>